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Center for Research and Innovation in Aquaculture

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Servicios

Genómica y Genética

Objetivos de cría y criterios de selección

Identificación de los rasgos deseables a ser incluidos en el objetivo de mejoramiento basado en un análisis económico dirigido a incrementar la rentabilidad de cada operación específica.

Índice económico para la selección genética de rasgos múltiples

Construcción de sistemas de evaluación genética de rasgos múltiples para mejorar simultáneamente más de un rasgo para maximizar la rentabilidad.

Estrategia de registro de fenotipado y pedigrí

Definición de las estrategias de fenotipado para el crecimiento, calidad de la canal y rasgos de robustez en el contexto de la operación de la empresa. Coordinación de recopilación de datos y desarrollo de bases de datos.

Evaluaciones genéticas de rutina

Estimación de parámetros genéticos (heredabilidades y correlaciones genéticas), estimación del mérito genético de los criadores mediante cálculos del valor de cría (EBV) utilizando las mejores metodologías lineales insesgadas (BLUP), identificación de mejores parejas y reporte de ganancia genética y niveles de consanguinidad en cada generación.

Diseño de planes de cría y esquemas de multiplicación

Maximización de la ganancia genética en cada generación y acelerar la diseminación de genética superior a la producción.

Esquemas de selección de masa asistida por moléculas

Implementación de esquemas de selección masiva asistidos por marcadores moleculares para maximizar la ganancia genética y mantener la diversidad genética y la endogamia.

Ensayos de evaluación comparativa

Diseño e implementación y análisis de actividades de benchmarking para evaluar los resultados del programa de mejoramiento genético.

Biobanco

Servicios de consultoría en archivo de material genético.

Servicios de genómica

Caracterización genética de reproductores basado en paneles SNP de baja densidad personalizados, es posible estimar la relación entre individuos, variabilidad y diversidad genética, diferenciación genética entre líneas, asesorando respecto de la inclusión de nuevo material genético, minimizar la probabilidad de depresión endogámica y una variabilidad/diversidad genética reducida (deformidades y disminución del rendimiento reproductivo).

Marcadores moleculares

Desarrollo de arreglos personalizados de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) de alta y baja densidad (96 a 1 millón de SNP) para la genotipificación eficiente en cualquier especie de acuicultura.

Estudios de asociación de genoma completo

Identificación de marcadores moleculares o QTL (loci de rasgos cuantitativos) que afectan rasgos económicamente importantes (crecimiento, rendimiento de la canal, resistencia a enfermedades, madurez tardía y determinación del sexo) para la implementación de la selección asistida por marcadores.

Selección genómica

Diseño e implementación de esquemas de selección genómica para acelerar el progreso genético de rasgos que son difíciles de medir en los candidatos de selección (por ejemplo, calidad de la canal y rasgos de resistencia a enfermedades).

Reconstrucción de pedigrí y asignación de paternidad

Asignación familiar de individuos para evaluaciones genéticas para predecir el mérito genético de los criadores si no han sido etiquetados físicamente durante las primeras etapas.

Estrategias de imputación para aplicaciones genómicas de bajo costo

Implementación de esquemas de selección genómica y GWA de bajo costo mediante el uso de paneles SNP de baja densidad y el desarrollo de estrategias eficientes de imputación.

Ensayos de secuenciación de alto rendimiento

Apoyo en el diseño y análisis de experimentos de secuenciación de genoma completo y genotipado por secuenciación (GBS) en una amplia gama de aplicaciones.

Expresión genética global

Apoyo en el diseño y análisis de secuenciación de transcriptomas completos, nutrigenómica y experimentos de PCR cuantitativa.

Secuenciación de genomas, transcriptomas de peces y patógenos y secuenciación de microbiomas

Plataforma de laboratorio para realizar secuenciaciones masivas (NGS) que permiten comprender de mejor manera la interrelación entre patógenos – peces, para posteriormente realizar la búsqueda de fármacos, nutrientes y aditivos que puedan ser incorporados en las dietas y mejorar la respuesta de los peces. Se incluye también la secuenciación de microbiomas.
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